Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

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• label() : ControlledVocabulary
• Label() : MultiplexDeltaMassesGenerator::Label
• LabeledPairFinder() : LabeledPairFinder
• labelSetToString() : MultiplexDeltaMasses
• largePeaksBeforeFirstIsotope_() : DIAScoring
• lastconsensus() : SpectrumCheapDPCorr
• lastReaction_() : ThermoRawFileMetadata
• lastScan() : ThermoRawScanReader, ThermoRawScanSelection
• le() : ParquetFilter, ParquetFilterBuilder
• leftBorderOfBin() : Histogram< ValueType, BinSizeType >
• level() : ThermoRawScanSelection
• level1Context_() : FragmentIonLikelihoodModel
• level2Context_() : FragmentIonLikelihoodModel
• LevMarqFitter1D() : LevMarqFitter1D
• lfdr() : MultipleTesting
• lfdrTransformToString() : MultipleTesting
• lightClone() : SpectrumAccessOnDisc, SpectrumAccessOpenMS, SpectrumAccessOpenMSCached, SpectrumAccessOpenMSInMemory, SpectrumAccessQuadMZTransforming, SpectrumAccessSqMass, SpectrumAccessTransforming, ISpectrumAccess
• LightCompound() : LightCompound
• LightTargetedExperiment() : LightTargetedExperiment
• linBin() : KernelDensityEstimation
• line_() : GlobalExceptionHandler
• linearIndex_() : IonImage
• LinearInterpolation() : LinearInterpolation< Key, Value >
• linearInterpolationAtY_() : MassTrace
• LinearRegression() : LinearRegression
• LinearRegressionWithoutIntercept() : LinearRegressionWithoutIntercept
• LinearResamplerAlign() : LinearResamplerAlign
• LinearResampling() : LinearResampling
• linkScanToHills_() : Biosaur2Algorithm
• listDirectories() : File
• listEntries() : ZipArchiveFile
• load() : AbsoluteQuantitationMethodFile, AbsoluteQuantitationStandardsFile, CachedmzML, ChromeleonFile, ConsensusXMLFile, CsvFile, CVMappingFile, DTA2DFile, DTAFile, EDTAFile, ExperimentalDesignFile, FASTAFile, FeatureXMLFile, IdXMLFile, IMSAlphabet, IMSAlphabetParser< AlphabetElementType, Container, InputSource >, ImzMLFile, IndexedMzMLFileLoader, InspectOutfile, OMSFileLoad, KroenikFile, MascotGenericFile, MascotXMLFile, MRMFeaturePickerFile, MRMFeatureQCFile, MS1LabeledSpectra, MS2File, MsInspectFile, MSPFile, MSPGenericFile, MzDataFile, MzIdentMLFile, MzMLFile, MzPeakFile, MzTabFile, MzXMLFile, OMSFile, OMSSACSVFile, OMSSAXMLFile, OpenSwathOSWParquetReader, ParamJSONFile, ParamXMLFile, PEFFFile, PepNovoOutfile, PepXMLFile, PepXMLFileMascot, PercolatorInfile, PercolatorOutfile, ProtXMLFile, PTMXMLFile, SequestOutfile, SpecArrayFile, SqMassFile, TextFile, TraMLFile, TransformationXMLFile, UnimodXMLFile, UniProtXMLFile, XICParquetFile, XIMParquetFile, XIPMParquetFile, XMassFile, XQuestResultXMLFile, XTandemXMLFile
• load_() : CachedmzML
• loadAdducts_() : OMSFileLoad
• loadBuffer() : MzMLFile
• loadConsensusColumnHeaders_() : OMSFileLoad
• loadConsensusFeatures() : FileHandler
• loadConsensusFeatures_() : OMSFileLoad
• loadDataProcessing_() : OMSFileLoad
• loadDBSearchParams_() : OMSFileLoad
• loadEnzymes() : BuiltInProteaseDataProvider, DigestionEnzymeDataProvider< EnzymeType >, EnzymeXMLDataProvider< EnzymeType >, InMemoryDigestionEnzymeDataProvider< EnzymeType >
• loadExperiment() : FileHandler
• loadFeatureAndSubordinates_() : OMSFileLoad
• loadFeatures() : FileHandler
• loadFeatures_() : OMSFileLoad
• loadFile() : TargetedDataFileLoader
• loadFromJSON_() : MonosaccharideDB
• loadFromMSExperiment() : SwathFile
• loadFromMSExperimentByFAIMSCV() : SwathFile
• loadFromOBO() : ControlledVocabulary
• loadFromProviders_() : DigestionEnzymeDB< DigestionEnzymeType, InstanceType >, ModificationsDB, RibonucleotideDB
• loadIdentifications() : FileHandler
• loadIdentifiedCompounds_() : OMSFileLoad
• loadIdentifiedSequences_() : OMSFileLoad
• loadImagingExperiment() : FileHandler
• loadImpl_() : ImzMLFile
• loadInputFiles_() : OMSFileLoad
• loadInSlices_() : UnimodXMLFile
• loadIrtExperimentFromFile_() : CalibrationWorkflow
• loadIsotopeModel_() : FeatureFindingMetabo
• loadMapMetaData_() : OMSFileLoad
• loadMapMetaDataTemplate_() : OMSFileLoad
• loadMetaData_() : OnDiscMSExperiment
• loadModel() : Percolator, SimpleSVM
• loadModifications() : InMemoryDataProvider, ModificationDataProvider, OBODataProvider, UnimodXMLDataProvider
• loadMS1Map() : OpenSwathWorkflow
• loadMzML() : MRMFile, SwathFile
• loadMzXML() : SwathFile
• loadObservationMatches_() : OMSFileLoad
• loadObservations_() : OMSFileLoad
• loadOnDisc() : SwathFile
• loadOnDiscByFAIMSCV() : SwathFile
• loadParallelIndexed_() : MzMLFile
• loadParentGroupSets_() : OMSFileLoad
• loadParentSequences_() : OMSFileLoad
• loadProcessingSoftwares_() : OMSFileLoad
• loadProcessingSteps_() : OMSFileLoad
• loadRegistry_() : ToolHandler
• loadRibonucleotides() : InMemoryRibonucleotideDataProvider, ModomicsJSONDataProvider, RibonucleotideDataProvider, RibonucleotideTSVDataProvider
• loadSamples_() : FIAMSScheduler
• loadScoreTypes_() : OMSFileLoad
• loadSize() : FeatureXMLFile, MzMLFile
• loadSpectra() : ProSEAlgorithm
• loadSpectraIndex() : ImzMLFile
• loadSpectrum() : FileHandler
• loadSplit() : SwathFile
• loadSqMass() : SwathFile
• loadStreaming() : UniProtXMLFile
• loadSwathFiles() : TOPPOpenSwathBase
• loadSwathFiles_() : TOPPOpenSwathBase
• loadTransformations() : FileHandler
• loadTransitionList() : TOPPOpenSwathBase
• loadTransitions() : FileHandler
• localFragmentEvidence_() : ProSEAlgorithm
• localizeNHS() : NuXLSiteLocalization
• localPeakDensities_() : ProSEAlgorithm
• localSlope() : ConsensusElutionWidth
• locateTerm() : SemanticValidator
• LockMass() : InternalCalibration::LockMass
• log_eval_no_normalize() : GaussFitter::GaussFitResult, GumbelDistributionFitter::GumbelDistributionFitResult, GumbelMaxLikelihoodFitter::GumbelDistributionFitResult
• LogConfigHandler() : LogConfigHandler
• logCorrectDensity_() : PosteriorErrorProbabilityModel
• logError_() : XMLValidator
• logfactorial_() : HyperScore
• logFeatureSpectraNumber() : SiriusExportAlgorithm
• login() : MascotRemoteQuery
• logIncorrectDensity_() : PosteriorErrorProbabilityModel
• logLikelihoodRatio() : FragmentIonLikelihoodModel
• LogMzPeak() : FLASHHelperClasses::LogMzPeak
• logOccupancyProb() : XQuestScores
• LogSinkGuard() : LogSinkGuard
• LogStream() : LogStream
• LogStreamBuf() : LogStreamBuf
• lookupAddFromHeader_() : PepXMLFile
• lookupKey_() : DigestionEnzymeDB< DigestionEnzymeType, InstanceType >
• lookupModInPreferredMods_() : PepXMLFile::AminoAcidModification
• Loss_function() : EmgGradientDescent, EmgGradientDescent_friend
• lowerBound() : NuXLPrecursorIndex, NuXLSpectrumIndex
• lowerBoundFDP() : EntrapmentEvaluation::Result
• LowessSmoothing() : LowessSmoothing
• lowIM() : AreaIterator< ValueT, ReferenceT, PointerT, SpectrumIteratorT, PeakIteratorT >::Param
• lowMZ() : AreaIterator< ValueT, ReferenceT, PointerT, SpectrumIteratorT, PeakIteratorT >::Param
• LPWrapper() : LPWrapper
• lt() : ParquetFilter, ParquetFilterBuilder